Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBRP36941 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBRP36941 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBRP36941 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBRP36941 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBRP36941 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBRP36941 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBRP36941 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBRP36941 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBRP36941 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBRP36941 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBRP36941 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTBRP36941 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBRP36941 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms