Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT2P35908 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT2P35908 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT2P35908 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT2P35908 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT2P35908 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT2P35908 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT2P35908 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT2P35908 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT2P35908 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT2P35908 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT2P35908 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT2P35908 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT2P35908 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT2P35908 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT2P35908 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT2P35908 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT2P35908 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT2P35908 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT2P35908 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT2P35908 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT2P35908 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT2P35908 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT2P35908 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT2P35908 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT2P35908 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms