Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THBS4P35443 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THBS4P35443 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THBS4P35443 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THBS4P35443 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THBS4P35443 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
THBS4P35443 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
THBS4P35443 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
THBS4P35443 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS4P35443 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS4P35443 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms