Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTPDP35247 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms