Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDXP35241 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDXP35241 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDXP35241 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDXP35241 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDXP35241 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDXP35241 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RDXP35241 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDXP35241 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDXP35241 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDXP35241 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDXP35241 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDXP35241 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDXP35241 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms