Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms