Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 XCL2-201ENST00000367819 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 LINC01571-201ENST00000563603 811 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC098617.1-207ENST00000594591 810 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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