Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA10P31260 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms