Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms