Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID4AP29374 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms