Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2E2P29084 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms