Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP1P28562 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms