Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLD1P28340 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLD1P28340 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLD1P28340 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLD1P28340 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLD1P28340 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLD1P28340 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLD1P28340 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
POLD1P28340 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLD1P28340 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLD1P28340 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLD1P28340 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POLD1P28340 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLD1P28340 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLD1P28340 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLD1P28340 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLD1P28340 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms