Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB2P26583 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms