Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPH2P23942 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms