Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms