Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPREP23469 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPREP23469 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPREP23469 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPREP23469 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPREP23469 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPREP23469 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPREP23469 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPREP23469 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPREP23469 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPREP23469 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPREP23469 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPREP23469 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPREP23469 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPREP23469 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPREP23469 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPREP23469 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPREP23469 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPREP23469 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPREP23469 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPREP23469 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPREP23469 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPREP23469 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPREP23469 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPREP23469 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPREP23469 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPREP23469 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPREP23469 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPREP23469 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPREP23469 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPREP23469 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPREP23469 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPREP23469 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPREP23469 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPREP23469 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPREP23469 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPREP23469 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPREP23469 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPREP23469 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPREP23469 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPREP23469 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPREP23469 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPREP23469 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPREP23469 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPREP23469 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms