Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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