Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP8P22894 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP8P22894 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP8P22894 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP8P22894 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP8P22894 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP8P22894 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP8P22894 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP8P22894 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP8P22894 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP8P22894 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP8P22894 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP8P22894 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP8P22894 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP8P22894 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP8P22894 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP8P22894 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP8P22894 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP8P22894 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP8P22894 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP8P22894 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP8P22894 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP8P22894 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP8P22894 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP8P22894 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP8P22894 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP8P22894 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP8P22894 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP8P22894 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP8P22894 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP8P22894 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP8P22894 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP8P22894 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP8P22894 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP8P22894 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP8P22894 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms