Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NF1P21359 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NF1P21359 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NF1P21359 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NF1P21359 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NF1P21359 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NF1P21359 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NF1P21359 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NF1P21359 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NF1P21359 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NF1P21359 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NF1P21359 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NF1P21359 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NF1P21359 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NF1P21359 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NF1P21359 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NF1P21359 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NF1P21359 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NF1P21359 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NF1P21359 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NF1P21359 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NF1P21359 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms