Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms