Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PDE6GP18545 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PDE6GP18545 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PDE6GP18545 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PDE6GP18545 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PDE6GP18545 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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