Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCLP18206 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCLP18206 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCLP18206 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCLP18206 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCLP18206 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCLP18206 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCLP18206 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCLP18206 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCLP18206 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCLP18206 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VCLP18206 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCLP18206 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCLP18206 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCLP18206 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCLP18206 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCLP18206 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCLP18206 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCLP18206 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCLP18206 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCLP18206 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCLP18206 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCLP18206 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms