Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms