Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZKSCAN1P17029 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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