Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UCHL3P15374 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UCHL3P15374 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms