Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms