Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL11A1P12107 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms