Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1P11387 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1P11387 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1P11387 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1P11387 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1P11387 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1P11387 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1P11387 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1P11387 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1P11387 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1P11387 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1P11387 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1P11387 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1P11387 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1P11387 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1P11387 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms