Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GLI4P10075 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GLI4P10075 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GLI4P10075 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GLI4P10075 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GLI4P10075 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms