Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM49CP0CI26 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM49CP0CI26 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms