Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP10P09238 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP10P09238 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP10P09238 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP10P09238 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP10P09238 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP10P09238 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP10P09238 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP10P09238 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP10P09238 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP10P09238 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP10P09238 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP10P09238 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP10P09238 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP10P09238 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP10P09238 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP10P09238 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP10P09238 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP10P09238 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP10P09238 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP10P09238 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP10P09238 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP10P09238 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP10P09238 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP10P09238 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP10P09238 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP10P09238 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP10P09238 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP10P09238 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP10P09238 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP10P09238 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP10P09238 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP10P09238 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP10P09238 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP10P09238 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP10P09238 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP10P09238 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms