Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms