Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
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