Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFMP07197 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFMP07197 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFMP07197 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFMP07197 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFMP07197 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFMP07197 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFMP07197 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFMP07197 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFMP07197 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFMP07197 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFMP07197 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFMP07197 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFMP07197 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFMP07197 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFMP07197 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFMP07197 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFMP07197 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFMP07197 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFMP07197 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms