Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCGP05129 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCGP05129 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms