Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APODP05090 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APODP05090 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APODP05090 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APODP05090 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APODP05090 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APODP05090 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APODP05090 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APODP05090 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APODP05090 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APODP05090 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APODP05090 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APODP05090 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APODP05090 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APODP05090 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APODP05090 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APODP05090 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APODP05090 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APODP05090 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APODP05090 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APODP05090 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APODP05090 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APODP05090 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APODP05090 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APODP05090 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APODP05090 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APODP05090 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APODP05090 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APODP05090 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APODP05090 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APODP05090 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APODP05090 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APODP05090 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APODP05090 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms