Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMCP01189 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMCP01189 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POMCP01189 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMCP01189 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMCP01189 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMCP01189 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMCP01189 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMCP01189 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMCP01189 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMCP01189 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMCP01189 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMCP01189 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMCP01189 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMCP01189 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMCP01189 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMCP01189 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMCP01189 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMCP01189 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMCP01189 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMCP01189 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMCP01189 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms