Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNTO95613 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNTO95613 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNTO95613 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNTO95613 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNTO95613 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNTO95613 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNTO95613 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNTO95613 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNTO95613 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNTO95613 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNTO95613 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNTO95613 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNTO95613 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNTO95613 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNTO95613 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNTO95613 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PCNTO95613 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNTO95613 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNTO95613 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms