Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms