Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms