Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLIT2O94813 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms