Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN11O75508 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms