Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR5O75473 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR5O75473 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR5O75473 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR5O75473 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR5O75473 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR5O75473 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR5O75473 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR5O75473 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR5O75473 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR5O75473 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR5O75473 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR5O75473 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR5O75473 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms