Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms