Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUBNO60494 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUBNO60494 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUBNO60494 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUBNO60494 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUBNO60494 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUBNO60494 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUBNO60494 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms