Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPLO60437 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPLO60437 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPLO60437 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPLO60437 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPLO60437 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPLO60437 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPLO60437 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPLO60437 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPLO60437 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPLO60437 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPLO60437 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPLO60437 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPLO60437 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPLO60437 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPLO60437 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPLO60437 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPLO60437 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPLO60437 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPLO60437 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.07■■■□□ 2.41
PPLO60437 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPLO60437 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPLO60437 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPLO60437 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPLO60437 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPLO60437 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPLO60437 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPLO60437 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPLO60437 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPLO60437 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PPLO60437 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPLO60437 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPLO60437 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PPLO60437 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPLO60437 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPLO60437 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPLO60437 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPLO60437 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPLO60437 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPLO60437 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPLO60437 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPLO60437 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPLO60437 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PPLO60437 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPLO60437 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPLO60437 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPLO60437 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PPLO60437 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms