Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3O43889 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3O43889 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3O43889 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3O43889 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3O43889 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB3O43889 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB3O43889 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3O43889 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3O43889 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3O43889 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3O43889 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3O43889 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3O43889 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms