Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DENRO43583 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DENRO43583 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DENRO43583 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DENRO43583 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DENRO43583 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DENRO43583 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DENRO43583 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DENRO43583 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms