Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNQ3O43525 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ3O43525 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms